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Gakkou no Kaidan, llamada Historias de Fantasmas en español, se centra en la historia de Satsuki Miyanoshita, que al morir su madre, ella junto con su padre y [[Keiichiro Miyanoshita], su hermano, se mudan a una nueva cuidad en donde se crió su madre -y en donde, en efecto, conoció al padre de Satsuki-. Allí, Satsuki comienza a estudiar en la misma escuela de su madre, en el nuevo edificio de ésta.

En el edificio viejo, Satsuki descubre que su madre tenía el don de capturar fantasmas, el cuál ella heredó. Esto pasó porque cuando la madre de Satsuki murió ella había encerrado a los fantasmas en un árbol sagrado, éste es cortado y es así como se liberan los fantasmas capturados en la escuela. Al percatarse de eso, Satsuki busca ayudarse con un diario que llevaba a la escuela y descubre que donde antes había páginas en blanco, ahora estaban ahí escritos sobre todos los fantasmas con los que ella tendrá que enfrentarse.

En el primer encuentro con un fantasma, Satsuki encierra al espectro en el cuerpo de su gato (de nombre Kaya) por no leer completamente una página del diario donde se habla sobre la manera de encerrar a los fantasmas. Su mascota, que ahora estaba poseído por el espíritu tiene como única solución para liberarse ayudar a Satsuki para dominar a los espíritus para recuperar su antigua forma.

Satsuki conoce en el primer episodio a Hajime, Reo y Momoko, con quienes ella comenzará su trabajo de capturar a los espíritus para sellarlos de nuevo.